naar homepagina
Onderzoek lectoraat Metabolomics via LC-MS

Verantwoording 2018

De verantwoording over 2018 van het lectoraat Metabolomics over de bijdrage aan de beroepspraktijk en maatschappij, aan onderwijs en professionalisering. 

Beroepspraktijk en maatschappij

Het lectoraat Metabolomics heeft zich beziggehouden met het (mee)schrijven van de volgende projecten:  

  1. Hoofdaanvrager RAAK KIEM HBO Vingerafdruk 2.0: het meten van chemische patronen in vingerafdrukken. (gehonoreerd) 
  2. Hoofdaanvrager RAAK KIEM HBO Liver on chip: ontwikkeling van meetmethoden om biotransformatie van geneesmiddelen in livers-on-chips te bepalen. (gehonoreerd)
  3. Hoofdaanvrager RAAK Publiek eDNA en eMetabolomics: moleculaire foto’s van het onderwaterleven. (gehonoreerd) 
  4. Mede-aanvrager RAAK PRO Rhinoceromics. Hoofdaanvrager is lector Willem van Leeuwen 
  5. Mede-aanvrager RAAK PRO Building A translational Test strategy to assess inTestinal dEfense-pRomoting potencY of natural Compounds (BATTERY). Hoofdaanvrager is lector Raymond Pieters, Hogeschool Utrecht 
  6. Mede-aanvrager Nationale WetenschapsAgenda Next generation tissue and disease models: designer vasculature and inflammation in organ-on-chip (DISIGN). Deze aanvraag is afgewezen. Hoofdaanvrager prof Erik Danen, LACDR, Universiteit Leiden  

Contact met werkveld 

Ter voorbereiding van RAAK-aanvragen is contact gezocht en onderhouden met een keur aan potentiële partners. Dit heeft geresulteerd een gehonoreerde RAAK Publiek-aanvraag en twee gehonoreerde KIEM-HBO aanvragen. 

De lector heeft twee workshops met betrekking tot de Nationale WetenschapsAgenda (NWA) bezocht, over de route Meten & Detecteren (20 juni en 6 juli). Daarnaast is een NWA match making event van Hogeschool Leiden en Universiteit Leiden bezocht.  

Er is op regelmatige basis contact met Naturalis, Centrum voor Milieukunde Leiden, Nederlands Forensisch Instituut, het lectoraat Analytische Technieken in de Life Sciences van Avans Hogeschool, het lectoraat Innovative Testing in Life Sciences & Chemistry van Hogeschool Utrecht, met de bedrijven MIMETAS, Bruker Daltonics, Interscience, Verstegen Kruiden en Wetsus Leeuwarden.  

Daarnaast is er intensieve samenwerking met Universiteit Leiden (Leiden Academic Centre for Drug Research, vakgroep Analytical Biosciences & Metabolomics, Thomas Hankemeier), in het kader waarvan een docent-onderzoeker van de opleiding Chemie samenwerkt met een universitair promovendus. Ook hebben drie studenten van onze hogeschool hun minorstage gedaan bij deze vakgroep. 

Het door het lectoraat op 9 mei georganiseerde symposium Metabolomics in Practice is een belangrijk platform voor contact met het werkveld. Het heeft geleid tot contact met het bedrijf GBS, waar momenteel een samenwerking mee wordt verkend. 

Onderwijs en professionalisering

Metabolomics is een relatief jong werkveld, het ligt in de lijn der verwachting dat het de komende jaren steeds belangrijker gaat worden voor uiteenlopende werkvelden zoals medische wetenschappen (personalized medicine), voeding, gewasontwikkeling, biodiversiteit, geneesmiddelonderzoek, ecologie, milieuwetenschap, etc. Hierom heeft het lectoraat een Minor Metabolomics ontwikkeld, die op dit moment voor de tweede keer loopt en toegankelijk is voor studenten van de opleidingen Biologie en Medische Laboratoriumonderzoek, Chemie en Bio-informatica. Deze minor is ons platform voor het vertalen van ons onderzoek naar onderwijs. De studenten worden door het docententeam van de opleiding Chemie onderwezen in systeemdenken, moderne analytische chemie en multivariate data-analyse. Hun minorstage voeren ze uit in een metabolomics-lab in het BioScience Park. Na afronding van deze minor zijn studenten er klaar voor om bij een metabolomics-laboratorium te gaan werken, of om door te stromen naar de master Biopharmaceutical Sciences: System Pharmacology. We streven ernaar de studenten zo autonoom en onafhankelijk mogelijk te maken en wakkeren hun enthousiasme voor het vakgebied zoveel mogelijk aan, zodat zij er een wezenlijke bijdragen aan kunnen gaan leveren in de toekomst. Voor metabolomics is kennis van de laatste ontwikkelingen in de Analytische Chemie onontbeerlijk. Samen met Chemie-docent-onderzoeker André van Roon is een uitdagend programma ontwikkeld, bestaande uit vier modules: 

  1. introduction into metabolomics 

  1. metabolomics technologies 

  1. reporting metabolomics data 

  1. metabolomics in practice 

De minor loopt op dit moment en wordt gevolgd door zes studenten. Er zijn vijf docenten van de opleiding Chemie betrokken bij de uitvoering.  

De lector heeft, naast de minor Metabolomics, de volgende bijdragen geleverd aan onderwijs: 

opleiding B&M; Minor Science of Cooking; module Chemistry of Cooking; les ‘Gas chromatography – olfactometry – mass spectrometry ‘meten + ruiken = weten’; 13 december 2018 

Metabolomics is een relatief jong werkveld, het ligt in de lijn der verwachting dat het de komende jaren steeds belangrijker gaat worden voor uiteenlopende werkvelden zoals medische wetenschappen (personalized medicine), voeding, gewasontwikkeling, biodiversiteit, geneesmiddelonderzoek, ecologie, milieuwetenschap, etc. Hierom heeft het lectoraat een Minor Metabolomics ontwikkeld, die op dit moment voor de tweede keer loopt en toegankelijk is voor studenten van de opleidingen Biologie en Medische Laboratoriumonderzoek, Chemie en Bio-informatica. Deze minor is ons platform voor het vertalen van ons onderzoek naar onderwijs. De studenten worden door het docententeam van de opleiding Chemie onderwezen in systeemdenken, moderne analytische chemie en multivariate data-analyse. Hun minorstage voeren ze uit in een metabolomics-lab in het BioScience Park. Na afronding van deze minor zijn studenten er klaar voor om bij een metabolomics-laboratorium te gaan werken, of om door te stromen naar de master Biopharmaceutical Sciences: System Pharmacology. We streven ernaar de studenten zo autonoom en onafhankelijk mogelijk te maken en wakkeren hun enthousiasme voor het vakgebied zoveel mogelijk aan, zodat zij er een wezenlijke bijdragen aan kunnen gaan leveren in de toekomst. Voor metabolomics is kennis van de laatste ontwikkelingen in de Analytische Chemie onontbeerlijk. Samen met Chemie-docent-onderzoeker André van Roon is een uitdagend programma ontwikkeld, bestaande uit vier modules: 

  1. introduction into metabolomics 

  1. metabolomics technologies 

  1. reporting metabolomics data 

  1. metabolomics in practice 

De minor loopt op dit moment en wordt gevolgd door zes studenten. Er zijn vijf docenten van de opleiding Chemie betrokken bij de uitvoering.  

De lector heeft, naast de minor Metabolomics, de volgende bijdragen geleverd aan onderwijs: 

  • opleiding B&M; Minor Science of Cooking; module Chemistry of Cooking; les ‘Gas chromatography – olfactometry – mass spectrometry ‘meten + ruiken = weten’; 13 december 2018
  • opleiding Bio-informatica; Minor Systems Biology; module Metabolomics & Proteomics (bmep); les en workshop Metabolomics; 23 mei 2018
  • opleiding Chemie; Hedendaagse Organische Chemie; twee lessen ‘Metabolomics voor Organisch Chemici’; 10 en 17 oktober  

Daarnaast hebben studenten van de minor Science of Cooking in het kader van hun onderzoeksprojecten metingen uitgevoerd in het lab van het lectoraat. 

Onderzoek/ Studenten/Medewerkers 

Er zijn vijf hbo-docenten, één MLO-docent en één ondersteuner actief geweest binnen het lectoraat. Daarnaast had de lector zitting in de sollicitatiecommissie voor het aanstellen van een analist Analytische Chemie, Faculteit Science & Technology. Deze analist is per 1 oktober in dienst gekomen. 

  • RAAK KIEM HBO Vingerafdruk 2.0: het meten van chemische patronen in vingerafdrukken
    • Twee Chemie-docenten en een student zijn werkzaam geweest in dit project 
  • RAAK KIEM HBO Liver on chip: ontwikkeling van meetmethoden om biotransformatie van geneesmiddelen in livers-on-chips te bepalen
    • Een Chemie-docent en een MLO Chemie-docent zijn werkzaam geweest in dit project 
  • RAAK Publiek eDNA en eMetabolomics: moleculaire foto’s van het onderwaterleven
    • Een hbo-docent en twee studenten zijn werkzaam geweest in dit project
  • RAAK Publiek With help of my little friends?”: Bestaat er een relatie tussen de samenstelling van de darmmicrobiota en/of metabolieten en het ontstaan van maag-darm- klachten tijdens duurinspanning? 
    • De analist is werkzaam geweest in dit project 

Ook zijn een docent en student Chemie werkzaam geweest om een methode te ontwikkelen voor de analyse van inhoudsstoffen in tomaten met ICP-OES. Door de analist Analytische Chemie is samen met de ondersteuner en een student een GC-MS methode ontwikkeld voor de analyse van kruiden, in samenwerking met het FoodLab. 

Het lectoraat Metabolomics is gestart met tweewekelijkse voortgangsbijeenkomsten, waarbij de bij het onderzoek betrokken docenten en studenten wetenschappelijke discussies voeren over hun data en onderzoeksplannen. Daarnaast worden ook de LCAB-brede researchbijeenkomsten bezocht. 

Kennisontwikkeling

Commissies/werkgroepen  

De lector is bestuurslid van de Werkgroep Scheidingsmethoden, een werkgroep van de Koninklijke Nederlandse Chemie Vereniging, die jaarlijkse symposia verzorgt voor academie en bedrijfsleven. Daarnaast neemt hij deel aan het LCAB lectoren- en coreteamoverleg en is hij toegetreden tot de DAS Werkgroep Onderzoek. 

Lezingen 

  • ‘Integration of Electroextraction in CE-MS for Analysis of Low Abundant Metabolites’ 34th International Symposium on Microscale Separations and Bioanalysis (Rio de Janeiro, 19-2-2018) 
  • ‘Analytical Challenges in Metabolomics’ Metabolomics in Practice 2018 (Leiden, 9-5-2018) 
  • ‘Research Group Metabolomics at University of Applied Sciences Leiden’ Benelux Metabolomics Days 2018 (Rotterdam, 20-9-2018) 
  • ‘Electroextraction-based sample preparation strategies for enrichment of low-abundant metabolites’, 3rd International Caparica Christmas Conference on Sample Treatment (Caparica, 3-12-2018)