Overslaan en naar de inhoud gaan Overslaan en naar de footer gaan Overslaan en naar de navigatie gaan
Zoeken

Analyse van Next Generation Sequencing (NGS) data

Cursus
  • Duur: 2 dagen
  • Start: 20-05-2025
  • Bewijs van deelname
  • Prijs: € 1.240,-
Schrijf je in
analyse next generation sequencing (NGS)

Dompel je twee dagen volledig onder in de wereld van Next Generation Sequencing analyse. We bespreken de verschillende sequence platforms en gaan in op toepassingen zoals SNP calling, RNA analyse en metagenomics. In de middagen ga je zelf aan de slag met NGS analyses tijdens de computerpraktijken.

Juliette Schlaghecke | Cursist
Er worden veel verschillende onderwerpen behandeld. Sprekers leggen die duidelijk uit

Iets voor jou?

Je bent een laboratoriummedewerker met hbo werk- en denkniveau, met bepekte kennis van NGS analyse. Je wil leren hoe je NGS data kunt analyseren. Liever alleen de basistheorie? Schrijf je dan eerst in voor Introductie NGS.

analyse next generation sequencing (NGS)

Over de cursus

In de ochtend vertellen enthousiaste (gast)docenten over de werking en toepassingen van NGS. Lectoren van de hogeschool Leiden komen vertellen over hun NGS onderzoek. In de middag ga je zelf met de data analyse aan de slag, via het programma Geneious. 

Deze 2-daagse training wordt verzorgd door meerdere docenten.

Leerdoelen

Je leert tijdens deze cursus niet alleen de basisprincipes en achtergronden ook leer je een aantal NGS toepassingen kennen; 

  • de basisprincipes van NGS te begrijpen;
  • toepassingen zoals reference alignment, SNP calling, metagenomics en RNA-seq analyse;
  • hoe je de kwaliteit van ruwe sequentiedata kunt bepalen;
  • waar je op moet letten bij het alignen en assembleren van NGS data;
  • hoe je de data analyseert en interpreteert. 
Programma

Programma Analyse van Next Generation  Sequencing (NGS) data (wijzigingen voorbehouden)

Dag 1   

09:30 - 10:00 Welkom en toelichting belangrijke NGS termen (Floyd Wittink) 
10:00 - 10:45 Introductie Next Generation Sequencing (Floyd Wittink)   
10.45 - 11.00 Koffiepauze     
11:00 - 11:45 NGS data kwaliteit (Hilda van Mourik)  
11:45 - 12:30 Alignen en assembleren (Floyd Wittink)
12.30 - 13.15  Lunchpauze
13:15 - 14:00 Introductie RNA sequencing (Koen Bossers)
14:00 - 15:00 Praktijk: De novo assembly (Hilda van Mourik en Sigrid Beiboer) 
15.00 - 15.15  Koffiepauze
15:15 - 16:00 Praktijk: RNA analyse (Hilda van Mourik en Sigrid Beiboer) 

Dag 2    

09:30 – 10:30 Metagenomics (Astrid Heikema)
10:30 – 11:30 Identificatie en annotatie van varianten (Peter Taschner)
11.30 – 11.45 Koffiepauze
11:45 – 12:30 Praktijk: SNP analyse (Hilda van Mourik en Sigrid Beiboer) 
12.30 – 13.15 Lunchpauze
13:15 – 14:45 Praktijk: Metagenomics (Hilda van Mourik en Sigrid Beiboer)
14.45 – 15.00 Koffiepauze
15:00 – 15:45 NGS toepassingen, metagenomics en biodiversiteit (Arjen Speksnijder)
15:45 – 16:00 Evaluatie en afsluiting (Hilda van Mourik en Sigrid Beiboer)   

 

Over de docenten

Deze cursus wordt verzorgd door Floyd Wittink, Koen Bossers, Hilda van Mourik, Sigrid Beiboer, Peter Taschner, Arjen Speksnijder, Astrid Heijkema. 

Opleidingstraject op maat

Voor alle cursussen van het Centrum Bioscience en Diagnostiek is het mogelijk om een maatwerktraject samen te stellen. De kracht hiervan is dat we tijdens de cursus direct kunnen inspelen op de unieke werksituatie en trainingsbehoeften van jouw organisatie. Je kunt hierbij kiezen voor een incompanytraining voor een groep medewerkers of een individueel traject.

Meer informatie aanvragen?
Ben je benieuwd naar de mogelijkheden van een maatwerktraject voor jouw organisatie, neem dan vrijblijvend contact met ons op via 071-5188743/753 of [email protected].

Rosan Kuipers | Cursist
‘’Veel nieuwe info, enthousiasme van de sprekers en de lengte van de dag was goed. Vooral de sprekers van dag 1 waren super, de inhoud was top!’’

Na afronding

  • Weet je: hoe NGS sequencing op verschillende platforms werkt 
  • Begrijp je: de manieren waarop je NGS kunt toepassen 
  • Kan je: zelf met Geneious NGS data analyseren

Puur praktisch

Duur en locatie

Lestijden
09.30-16.00 uur

Omvang
12 uur theorie/computerpracticum (16UEC)

Locatie
Hogeschool Leiden

Kosten en planning

Cursusprijs
€ 1.240,- (bij inschrijving vóór 11 februari 2025 € 1.130,-)

Cursusdata
20 en 21 mei 2025

Inschrijven

De eerstvolgende cursus start 20 mei 2025. Wil je verzekerd zijn van een plaats? Schrijf je in vóór 8 april 2025.

Algemene voorwaarden

Voor alle post-hbo opleidingen, cursussen en maatwerktrajecten gelden de algemene leverings- en annuleringsvoorwaarden van Hogeschool Leiden.

Keuze gemaakt?

Leuk! We kijken uit naar je komst. De eerstvolgende cursus start op 20 mei 2025.

Schrijf je in

Twijfel je nog?

Wil je hulp bij het kiezen van de juiste nascholing? Of heb je een andere vraag? Gebruik het contactformulier, bel 071-51 88 743 of 071-51 88 753 of stuur een e-mail naar [email protected].

Neem contact op

Centrum Bioscience en Diagnostiek

Ontwikkel jouw groei

Deze cursus maakt onderdeel uit van het nascholingsaanbod van Centrum Bioscience en Diagnostiek (CBD). Het vakgebied life science en health staat nooit stil. Samen met diverse partners uit het werkveld ontwikkelt CBD daarom opleidingen en nascholingen die inspelen op wat er, nu én in de toekomst, nodig is in de sector.

Meer weten over CBD

Blijf op de hoogte

Mis de nieuwsbrief van het Centrum Bioscience en Diagnostiek niet!

Meld je aan
Kijk nog even verder

Blijf jezelf ontwikkelen

Effectieve communicatie in het lab

Cursus
Lees meerover Effectieve communicatie in het lab
Student LCAB bezig in laboratorium met pipetten

Nanopore sequencing (MinION)

Cursus
Lees meerover Nanopore sequencing (MinION)
Nanopore sequencing (MinION)

Genome editing: CRISPR design

Cursus
Lees meerover Genome editing: CRISPR design
Header Microbiologie CBD

Algemene voorwaarden

Voor alle post-hbo opleidingen, cursussen en maatwerktrajecten gelden de algemene leverings- en annuleringsvoorwaarden van Hogeschool Leiden.