Analyse van Next Generation Sequencing (NGS) data

Je leert tijdens deze cursus niet alleen de basisprincipes en achtergronden ook leer je een aantal NGS toepassingen kennen; 

• de basisprincipes van NGS te begrijpen;
• toepassingen zoals reference alignment, SNP calling, metagenomics en RNA-seq analyse;
• hoe je de kwaliteit van ruwe sequentiedata kunt bepalen;
• waar je op moet letten bij het alignen en assembleren van NGS data;
• hoe je de data analyseert en interpreteert. 

Programma Analyse van Next Generation  Sequencing (NGS) data (wijzigingen voorbehouden)

Dag 1   

09:30 - 10:00 Welkom en toelichting belangrijke NGS termen (Floyd Wittink) 
10:00 - 10:45 Introductie Next Generation Sequencing (Floyd Wittink)   
10.45 - 11.00 Koffiepauze     
11:00 - 11:45 NGS data kwaliteit (Hilda van Mourik)  
11:45 - 12:30 Alignen en assembleren (Floyd Wittink)
12.30 - 13.15  Lunchpauze
13:15 - 14:00 Introductie RNA sequencing (Koen Bossers)
14:00 - 15:00 Praktijk: De novo assembly (Hilda van Mourik en Sigrid Beiboer) 
15.00 - 15.15  Koffiepauze
15:15 - 16:00 Praktijk: RNA analyse (Hilda van Mourik en Sigrid Beiboer) 

Dag 2    

09:30 – 10:30 Metagenomics (Astrid Heikema)
10:30 – 11:30 Identificatie en annotatie van varianten (Peter Taschner)
11.30 – 11.45 Koffiepauze
11:45 – 12:30 Praktijk: SNP analyse (Hilda van Mourik en Sigrid Beiboer) 
12.30 – 13.15 Lunchpauze
13:15 – 14:45 Praktijk: Metagenomics (Hilda van Mourik en Sigrid Beiboer)
14.45 – 15.00 Koffiepauze
15:00 – 15:45 NGS toepassingen, metagenomics en biodiversiteit (Arjen Speksnijder)
15:45 – 16:00 Evaluatie en afsluiting (Hilda van Mourik en Sigrid Beiboer)   

Deze cursus wordt verzorgd door Floyd Wittink, Koen Bossers, Hilda van Mourik, Sigrid Beiboer, Peter Taschner, Arjen Speksnijder, Astrid Heijkema. 

Voor alle cursussen van het Centrum Bioscience en Diagnostiek is het mogelijk om een maatwerktraject samen te stellen. De kracht hiervan is dat we tijdens de cursus direct kunnen inspelen op de unieke werksituatie en trainingsbehoeften van jouw organisatie. Je kunt hierbij kiezen voor een incompanytraining voor een groep medewerkers of een individueel traject.

Meer informatie aanvragen?
Ben je benieuwd naar de mogelijkheden van een maatwerktraject voor jouw organisatie, neem dan vrijblijvend contact met ons op via 071-5188743/753 of [email protected].