Overslaan en naar de inhoud gaan Overslaan en naar de footer gaan Overslaan en naar de navigatie gaan
Zoeken

Introductie Next Generation Sequencing (NGS)

Cursus
  • Duur: 1 dag
  • Start: 17-10-2024
  • Bewijs van deelname
  • Prijs: € 660,-
Schrijf je in

De cursus gaat door. Na-inschrijving is mogelijk tot 3 oktober 2024.

Het bepalen van een compleet genoom of juist gericht op zoek naar mutaties daarin; nu NGS apparaten steeds kleiner en goedkoper worden is deze techniek voor allerlei laboratoria bereikbaar geworden.  Tijdens deze introductiecursus leer je verschillende sequencers die op de markt zijn kennen, behandelen we wat de voor- en nadelen van elk apparaat zijn en gaan we in op de monsterpreparatie van meest gebruikte sequencers. We gaan in op controles en kwaliteit van de data, en geven voorbeelden van wat er met de data onderzocht kan worden.

Iets voor jou?

Je bent een laboratoriummedewerker die NGS (wil gaan)  gebruiken, of arts die met NGS uitslagen werkt. Minimaal hbo werk- en denkniveau.

Introductie Next Generation Sequencing (NGS)

Over de cursus

Tijdens deze eendaagse cursus van 09.30-16.30 uur wisselen theoriecolleges en opdrachten elkaar af.

Tijdens het ochtendprogramma beginnen we bij de basis: hoe werken verschillende sequencers en wat zijn de verschillen? Ook nemen we een voorbeeld van monsterpreparatie van een Illumina sequencer stap voor stap door.

In de middag ga je met opdrachten aan de slag met de geleerde stof en duiken we dieper in de werking van het sequenceapparaat. We kijken kort naar de analyse van de output van een sequence run, en er is ruimte om met een eigen casus aan de slag te gaan.

Leerdoelen

Je leert: 

  • de basisbegrippen die nodig zijn om de techniek te begrijpen:  target DNA, read, oligo, adaptor, cluster density, coverage, library, VCF, bridge amplification, multiplexen, fastq, paired-end;
  • hoe de monsterpreparatie voor een illumina sequencing werkt;
  • wat het doel en de kritische factoren van de stappen van NGS zijn; 
  • de manier van base-bepaling van meerdere NGS sequencemethoden;
  • de voor- en nadelen van de verschillende technieken;
  • hoe de kwaliteit van sequence resultaten wordt gemeten;
  • welke controles worden meegenomen bij een NGS en hoe deze worden beoordeeld; 
  • welke invloed de verschillende monsterpreparatie stappen hebben op de kwaliteit;
  • wat de toepassingen van NGS kunnen zijn.
Programma

Programma Introductie Next Generation Sequencing
(wijzigingen voorbehouden)

09:30Inloop
09:30-09:45Opening en inventarisatie verwachtingen van de dag
09:45-10:45College 1: NGS introductie
Wat houdt de techniek in, welke apparaten zijn er, wat zijn er
voor mogelijkheden en wat kun je ermee doen?
10:45-11:00Kort koffiemoment
11:00-11:30College 2: Library preparatie workflow
Hoe werkt het protocol voor een sample voorbewerking voor
een (Illumina) NGS bepaling? Stapsgewijze uitleg.
11:30-12:00Werkcollege: ‘Library preparatie workflow’
12:00-13:00Lunchpauze
13:00-13:45Bespreken opdracht
13:45-14:45College 3: Illumina sequencers
Hoe werkt een illumina sequencer eigenlijk? Hoe komt de data
tot stand?
14:45-15:00Kort koffiemoment
15:00-16:45Interactief discussie college 4: Output van een NGS
experiment Invloed van monsteropwerking op datakwaliteit
Ruimte voor Case studies en specifieke vragen van deelnemers
16:45- 17:00Afsluiting en korte evaluatie
17:00Einde scholingsdag en uitreiking Bewijs van deelname
Over de docent

Deze cursus wordt verzorgd door Ken Kraaijeveld.

Ken Kraaijeveld is evolutionair bioloog. Hij doet allerlei DNA-onderzoek bij het Leiden Centre of Applied Bioscience: van het bodemleven in tulpenvelden tot het Y chromosoom van de zwarte neushoorn. Ook geeft hij les bij de opleiding Bio-informatica aan de Hogeschool leiden, met name op vakken over Next Generation Sequencing. Ingewikkelde dingen op een toegankelijke manier uitleggen doet hij zowel graag in zijn lessen als op papier; zo schreef hij ook het populair-wetenschappelijke boek ‘Waarom je hond geen fruit hoeft te eten’.

Opleidingstraject op maat

Voor alle cursussen van het Centrum Bioscience en Diagnostiek is het mogelijk om een maatwerktraject samen te stellen. De kracht hiervan is dat we tijdens de cursus direct kunnen inspelen op de unieke werksituatie en trainingsbehoeften van jouw organisatie. Je kunt hierbij kiezen voor een incompanytraining voor een groep medewerkers of een individueel traject.

Meer informatie aanvragen?
Ben je benieuwd naar de mogelijkheden van een maatwerktraject voor jouw organisatie, neem dan vrijblijvend contact met ons op via 071-5188743/753 of [email protected].

Na afronding

  • Weet je: welke NGS sequencers er bestaan 
  • Begrijp je: hoe NGS experimenten werken 
  • Kun je: uitleggen wat de belangrijke stappen van monsterpreparatie voor NGS zijn en waarom 

Puur praktisch

Duur en Locatie

Lestijden
09:30-16:30 uur

Omvang
6,5 uur theorie

Locatie
Hogeschool Leiden

Kosten en planning

Prijs
€ 660,- (bij inschrijving vóór 11 juli 2024 € 600,-)

Cursusdatum
17 oktober 2024

Inschrijven

De eerstvolgende cursus Introductie Next Generation Sequencing start op 17 oktober 2024. Wil je verzekerd zijn van een plaats? Schrijf je in vóór 5 september 2024. Na-inschrijving is mogelijk tot 3 oktober 2024.

Algemene voorwaarden

Voor alle post-hbo opleidingen, cursussen en maatwerktrajecten gelden de algemene leverings- en annuleringsvoorwaarden van Hogeschool Leiden.

Keuze gemaakt?

Leuk! We kijken uit naar jouw komst. De eerstvolgende cursus Introductie Next Generation Sequencing (NGS) start 17 oktober 2024. 

Tip: Schrijf je in vóór 11 juli 2024 en ontvang vroegboekkorting. 

Schrijf je in

Twijfel je nog?

Wil je hulp bij het kiezen van de juiste nascholing? Of heb je een andere vraag? Gebruik het contactformulier, bel 071-51 88 743 of 071-51 88 753 of stuur een e-mail naar [email protected].

Neem contact op

Centrum Bioscience en Diagnostiek

Ontwikkel jouw groei

Deze cursus maakt onderdeel uit van het nascholingsaanbod van Centrum Bioscience en Diagnostiek (CBD). Het vakgebied life science en health staat nooit stil. Samen met diverse partners uit het werkveld ontwikkelt CBD daarom opleidingen en nascholingen die inspelen op wat er, nu én in de toekomst, nodig is in de sector.

Meer weten over CBD

Blijf op de hoogte

Mis de nieuwsbrief van het Centrum Bioscience en Diagnostiek niet!

Meld je aan
Kijk nog even verder

Blijf jezelf ontwikkelen

Analyse van Next Generation Sequencing (NGS) data

Cursus
Lees meerover Analyse van Next Generation Sequencing (NGS) data
analyse next generation sequencing (NGS)

Introductiedag Digitale PCR

Cursus
Lees meerover Introductiedag Digitale PCR
Foto over moleculaire biologie

Projectmatig werken in het lab

Cursus
Lees meerover Projectmatig werken in het lab
Student LCAB bezig in laboratorium met pipetten

Algemene voorwaarden

Voor alle post-hbo opleidingen, cursussen en maatwerktrajecten gelden de algemene leverings- en annuleringsvoorwaarden van Hogeschool Leiden.