Primer en probe design

Cursus

Duur: 2 dagen
Start: Najaar 2025
Bewijs van deelname
Prijs: n.n.b.

Ik heb interesse

De datum van de eerstvolgende cursus in 2025 is momenteel niet bekend. Heb je interesse en wil je op de hoogte worden gehouden van de nieuwe cursusdata? Vul dan het interesseformulier in.

Om een succesvolle (q)PCR bepaling te kunnen ontwikkelen, zijn goede primers en probes essentieel. Volg de workshop primer en probe design voor toepasbare en up-to-date informatie. We behandelen verschillende probe-types, speciale toepassingen van primers/probes, het ontwikkelen van multiplex PCR testen en eigenschappen van fluoroforen en quenchers. Tijdens het computerpracticum voer je de belangrijkste stappen van primer design en amplimeer- en targetsequentie analyse uit met behulp van verschillende web-based programma’s.

Ivo Horn - Moleculair bioloog en docent Biologie Medisch Laboratoriumonderzoek

Dat je cursisten aanzet om over dingen na te denken en er dan dieper op ingaat waardoor cursisten begrijpen waar het over gaat, dat maakt het onderwijs zo waardevol

Iets voor jou?

Je bent een laboratoriummedewerker op hbo-niveau die zijn kennis van primer en probe design wil aanvullen.

Deeltijdstudenten Hogeschool Leiden Informatica: Forensisch ICT doen opdracht in klaslokaal

Over de workshop

In twee volle lesdagen krijg je toepasbare up-to-date informatie over primer en probe design en leer je het ontwerpen van goede primers en probes in de praktijk.

Op de eerste dag komen eisen aan primers en speciale primers voor de PCR aan bod. 's Middags is er een computerpracticum en krijg je informatie over Beacon Designer. Op de tweede en laatste dag komen onderwerpen als primers en probes voor real-time PCR en de Tm van primers en probes voorbij. In de middag doe je computerpracticum en is er een casusbespreking.

Leerdoelen

Je leert:

de regels van het ontwerpen van goede primers en probes voor (q)PCR bepalingen;
hoe je genomische data kunt opzoeken in databanken en daar probes en primers op kunt ontwerpen;
hoe je mutaties kunt opzoeken in databanken en daar probes op kunt ontwerpen;
hoe je combinaties van één primerpaar met meerdere probes kunt ontwerpen om bijvoorbeeld virussen te onderscheiden;
hoe je multiplex PCRs kunt opzetten;
hoe je allelspecifieke primers kunt ontwerpen.

Programma

Programma cursus Primer en probe design (wijzigingen voorbehouden)

Dag 1

09.00 - 09.30	Ontvangst met koffie/thee
09.30 - 10.45	Welkom & Primer design I: Eisen aan primers Sigrid Beiboer
10.45 - 11.00	Pauze
11.00 - 12.00	Computerpracticum Kitty Verzijlbergen
12.00 - 12.45	Lunch
12.45 - 14.15	Computerpracticum / Demonstratie Beacon Designer Kitty Verzijlbergen
14.15 - 15.00	Primer design II: speciale primers voor de PCR Sigrid Beiboer
15.00 - 15.15	Pauze
15.15 - 16.00	Voorbeeld primer en probe design voor multiplex PCR Gastdocent

Dag 2

09.00 - 09.30	Ontvangst met koffie/thee
09.30 - 10.15	Primers en probes voor Real Time PCR I Kitty Verzijlbergen
10.15 - 11.00	Primers en probes voor Real Time PCR II Kitty Verzijlbergen
11.00 - 11.15	Pauze
11.15 - 12.00	De Tm van primers en probes Kitty Verzijlbergen
12.00 - 12.45	Lunch
12.45 - 15.00	Computerpracticum Sigrid Beiboer & Kitty Verzijlbergen
15.00 - 15.15	Pauze
15.15 - 16.00	Praktijkvoorbeelden / casusbespreking Rob van Gijlswijk
16.00 - 16.15	Evaluatie & afsluiting

Over de docenten

De cursus Primer en probe design wordt verzorgd door Sigrid Beiboer, Ivo Horn en Kitty Verzijlbergen.

Sigrid Beiboer is docent Biochemie en Moleculaire biologie op Hogeschool Leiden. Voor het CBD geeft ze cursussen in dit vakgebied. Ze studeerde Biochemie in Groningen en promoveerde aan de Universiteit van Utrecht op protein engineering. Bij Sanquin werd haar interesse voor moleculaire diagnostiek aangewakkerd. Sigrid werkte op dit lab als onderzoeker en ontwikkelde een DNA chip om bloeddonoren te typeren.

Opleidingstraject op maat

Voor alle cursussen van het Centrum Bioscience en Diagnostiek is het mogelijk om een maatwerktraject samen te stellen. De kracht hiervan is dat we tijdens de cursus direct kunnen inspelen op de unieke werksituatie en trainingsbehoeften van jouw organisatie. Je kunt hierbij kiezen voor een incompanytraining voor een groep medewerkers of een individueel traject.

Meer informatie aanvragen?
Ben je benieuwd naar de mogelijkheden van een maatwerktraject voor jouw organisatie, neem dan vrijblijvend contact met ons op via 071-5188743/753 of [email protected].

Sigrid Beiboer - Docent Biochemie en Moleculaire biologie

Waar ik energie van krijg, is als je ziet dat mensen er wat aan hebben, dat ze het ineens begrijpen.

Na afronding

weet je wat de eisen aan primers en probes voor de qPCR zijn;
begrijp je hoe je met combinaties van één primerpaar met meerdere probes verschillende targets in één monster kan detecteren;
kun je genomische data opzoeken in databanken, daar probes en primers ontwerpen en multiplex PCRs ontwerpen.

Puur praktisch

Duur en locatie

Lestijden
09.30 uur tot 16.00 uur

Omvang
6 uur theorie, 6 uur bio-informatica practicum (15 UEC)

Locatie
Hogeschool

Kosten en planning

Cursusprijs
Nog niet bekend

Cursusdata
De datum van de eerstvolgende cursus in 2025 is momenteel niet bekend. Heb je interesse en wil je op de hoogte worden gehouden van de nieuwe cursusdata? Vul dan het interesseformulier in.

Inschrijven

De datum van de eerstvolgende cursus in 2025 is momenteel niet bekend. Heb je interesse en wil je op de hoogte worden gehouden van de nieuwe cursusdata? Vul dan het interesseformulier in.

Algemene voorwaarden

Voor alle post-hbo opleidingen, cursussen en maatwerktrajecten gelden de algemene leverings- en annuleringsvoorwaarden van Hogeschool Leiden.

Keuze gemaakt?

De datum van de eerstvolgende cursus in 2025 is momenteel niet bekend. Heb je interesse en wil je op de hoogte worden gehouden van de nieuwe cursusdata? Vul dan het interesseformulier in.

Ik heb interesse

Twijfel je nog?

Wil je hulp bij het kiezen van de juiste nascholing? Of heb je een andere vraag? Gebruik het contactformulier, bel 071-51 88 743 of 071-51 88 753 of stuur een e-mail naar [email protected].

Neem contact op

Centrum Bioscience en Diagnostiek

Ontwikkel jouw groei

Deze cursus maakt onderdeel uit van het nascholingsaanbod van Centrum Bioscience en Diagnostiek (CBD). Het vakgebied life science en health staat nooit stil. Samen met diverse partners uit het werkveld ontwikkelt CBD daarom opleidingen en nascholingen die inspelen op wat er, nu én in de toekomst, nodig is in de sector.

Meer weten over CBD