Culturomics and Genome Discovery
We onderzoeken hoe we met behulp van de meest innovatieve methodes nieuwe bacteriesoorten en -stammen kunnen kweken.
Contact
Astrid Heikema
Lector Microbial Genomics
Ons doel
We onderzoeken hoe we met nieuwe kweekmethoden nieuwe bacteriesoorten en -stammen kunnen kweken en werken aan een bio-informaticapijplijn om interessante, genetische eigenschappen voor verschillende toepassingen te identificeren.
Samenwerking
Culturomic and Genome Discovery is een samenwerking met BaseClear, onze kennispartner en expert op het gebied van laboratoriumonderzoek.
Wat en hoe?
- Verschillende complexe ecosystemen dienen als bron voor de bacteriële kweken.
- Met behulp van studenten wordt er gewerkt aan een bio-informaticapijplijn om interessante genetische eigenschappen voor verschillende toepassingen te identificeren.
Technieken
- Whole Genome Sequencing
- Metagenomics
- Innovatieve kweektechnieken
- Data analyse/genome mining/ gene discovery
Projectinformatie
Type project
RAAK-mkb
Status
Lopend
Onderzoeksgroep(en)
Microbial Genomics, Bio-informatica
Projectleiding
Astrid Heikema
Onderzoeker(s)
Floyd Wittink (BI), Koen Bossers (BI)
Analist(en)
Mara Kröner, Marieke Eikenboom- van den Berg
Student(en)
1-2 student BM 4e jaars, 4 BPEXA studenten 3e jaars BI
Partner(s)
Diverse bedrijven
