Hogeschool Leiden

Primer en probe design

  • Workshop
  • Moleculaire biologie
  • Start 17 juni 2020
  • Duur 2 dagen
  • Nederlandstalig
  • Bewijs van deelname

In het kort

Om een succesvolle (q)PCR bepaling te kunnen ontwikkelen zijn goede primers en probes essentieel. Volg de workshop primer en probe design voor toepasbare en up-to-date informatie. We behandelen verschillende probe-types, speciale toepassingen van primers/probes. Het ontwikkelen van multiplex PCR testen, eigenschappen van fluoroforen en quenchers. Tijdens het bio-informatica practicum voer je de belangrijkste stappen van primer design en amplimeer- en targetsequentie analyse uit met behulp van verschillende web-based programma’s. 

Voor wie
Deze workshop is bedoeld voor laboratoriummedewerkers op hbo niveau die hun kennis van primer en probe design willen aanvullen.

Centrum Bioscience en Diagnostiek

Deze cursus maakt onderdeel uit van het nascholingsaanbod van het Centrum Bioscience en Diagnostiek (CBD). Het vakgebied life science en health staat nooit stil. Samen met diverse partners uit het werkveld ontwikkelt het CBD daarom opleidingen en nascholingen die inspelen op wat er, nu én in de toekomst, nodig is in de sector.

Nieuwsgierig? Bekijk het actuele opleidingsaanbod.

Vragen? Neem contact met ons op.

Wat je leert tijdens deze workshop

Tijdens deze workshop leer je:

  • de regels van het ontwerpen van goede primers en probes voor (q)PCR bepalingen;
  • hoe je genomische data kunt opzoeken in databanken en daar probes en primers op kunt ontwerpen;
  • hoe je mutaties kunt opzoeken in databanken en daar probes op kunt ontwerpen;
  • hoe je combinaties van 1 primerpaar met meerdere probes kunt ontwerpen om virussen te onderscheiden;
  • hoe je multiplex PCRs kunt opzetten;
  • hoe je allel specifieke primers kunt ontwerpen.

 

 

 

Vergelijkbare cursussen

Jezelf verder ontwikkelen op het gebied van life science en health? Vanuit het CBD bieden we diverse cursussen, masterclasses, workshops en andere opleidingstrajecten aan. Mogelijk vind je de volgende nascholingen ook interessant: De PCR van A-Z, Masterclass kwaliteitsanalyse van real-time PCR amplificatiecurven, Introductie tot de (real-time) PCR en Kwaliteitsaspecten en 'trouble-shooting' bij PCR technologie.

Bekijk alle cursussen op het gebied van Moleculaire Biologie

Programma

In twee lesdagen van 9.30-16.00 uur krijg je toepasbare up-to-date informatie over primer en probe design en leer je het ontwerpen van goede primers en probes in de praktijk. De cursusdata zijn 17 en 18 juni 2020.

Dag 1
Op de eerste dag komen eisen aan primers en speciale primers voor de PCR aan bod. 's Middags is er een computerpracticum en krijg je informatie over Beacon Designer.

Dag 2
Op de tweede en laatste dag komen onderwerpen als primers en probes voor real-time PCR en de Tm van primers en probes voorbij. Opnieuw in de middag een computerpracticum en daarna een casusbespreking.

Bekijk het volledige programma

De cursus Primer en probe design wordt verzorgd door Sigrid Beiboer, Ivo Horn en Rob van Gijlswijk.

Sigrid Beiboer

Docente Sigrid Beiboer

Sigrid Beiboer is docent Biochemie en Moleculaire biologie op Hogeschool Leiden. Voor het CBD geeft ze cursussen in dit vakgebied. Ze studeerde Biochemie in Groningen en promoveerde aan de Universiteit van Utrecht op protein engineering. Bij Sanquin werd haar interesse voor moleculaire diagnostiek aangewakkerd. Sigrid werkte op dit lab als onderzoeker en ontwikkelde een DNA chip om bloeddonoren te typeren.  

“Waar ik energie van krijg, is als je ziet dat mensen er wat aan hebben, dat ze het ineens begrijpen.”

Ivo Horn

Docent Ivo Horn

Ivo Horn is moleculair bioloog. Hij doet onderzoek en geeft onderwijs bij de opleiding Biologie en Medisch Laboratoriumonderzoek van Hogeschool Leiden. Aan de Universiteit van Amsterdam deed hij wetenschappelijk onderzoek naar de moleculaire biologie van eiwitten. Hij werkte bij onderzoeksinstituten in binnen- en buitenland, bij ziekenhuizen en bij Naturalis. “Hoe meer werkervaring, hoe interessanter je lessen”, vindt Ivo. Op basis van signalen uit het werkveld, bedenkt Ivo welke cursussen hij wil geven. 

“Dat je cursisten aanzet om over dingen na te denken en er dan dieper op ingaat waardoor cursisten begrijpen waar het over gaat, dat maakt het onderwijs zo waardevol.”

Rob van Gijlswijk

Docent Rob van Gijlswijk

Rob van Gijlswijk is docent Moleculaire Biologie op Hogeschool Leiden. Hij werkte als biochemisch analist en onderzoeker op het LUMC, waar hij promoveerde op het zo gevoelig mogelijk detecteren van eiwitten en nucleïnezuren in cellen. Toen hij voor het biotech bedrijf Kreatech cursussen ging geven, was hij verkocht voor het onderwijs. Het is een uitdaging om je kennis te gebruiken en zo goed mogelijk over te brengen. Ideeën omzetten naar praktisch onderwijs is Rob zijn specialiteit. 

Heel leuk om nieuwe onderwijsvormen te bedenken voor cursussen. Niet vertellen maar in de praktijk brengen, is mijn credo.”

Voor alle cursussen van het Centrum Bioscience en Diagnostiek is het mogelijk om een maatwerktraject samen te stellen. De kracht hiervan is dat we tijdens de cursus direct kunnen inspelen op de unieke werksituatie en trainingsbehoeften van jouw organisatie. Je kunt hierbij kiezen voor een incompanytraining voor een groep medewerkers of een individueel traject.

Meer informatie aanvragen?
Ben je benieuwd naar de mogelijkheden van een maatwerktraject voor jouw organisatie, neem dan vrijblijvend contact met ons op via 071-5188743/753 of cbd@hsleiden.nl.

Schrijf je in voor de cursus

De eerstvolgende Workshop primer en probe design gaat van start op 17 juni 2020. Wil jij verzekerd zijn van een plaats? Schrijf je in vóór 6 mei 2020.

Bij inschrijving voor 9 april 2020 ontvang je vroegboekkorting. Ook is het mogelijk om een kortingsregeling te krijgen bij inschrijving van twee of meer deelnemers van dezelfde afdeling van een bedrijf. Voor alle post-hbo opleidingen, cursussen, workshops, masterclasses en maatwerktrajecten gelden de algemene leveringsvoorwaarden van Hogeschool Leiden.

Praktische informatie

Ben je van plan om deel te nemen aan de Workshop primer en probe design? Bekijk hier de praktische informatie over de data, lestijden en de kosten.

Doelgroep
Laboratoriummedewerkers op hbo-niveau

Cursusniveau
Hbo

Cursusdata
17 en 18 juni 2020

Lestijden
09.30 - 16.00 uur

Omvang
7 uur theorie, 7 uur bio-informatica practicum (13 UEC)

Getuigschrift
Bewijs van deelname

Inschrijven
Schrijf je in vóór 6 mei 2020

Cursusprijs
€ 860,- (bij inschrijving vóór 9 april 2020 betaal je € 780,-)

Indien u de Workshop Primer en probe design volgt in combinatie met de cursus De PCR van A tot Z of de cursus Introductie tot de (real-time) PCR, dan ontvangt u € 100,- korting op de prijs van de Workshop Primer en probe design.

Centrum Bioscience en Diagnostiek (CBD)

Het vakgebied life science en health staat nooit stil. Samen met diverse partners uit het werkveld ontwikkelt het CBD daarom opleidingen en nascholingen die inspelen op wat er, nu én in de toekomst, nodig is in de sector.