Onderzoeksprojecten Vakgroep Bio-Informatica
Dit zijn de actuele onderzoeksprojecten van de Vakgroep Bio-Informatica:
- Check the test; onderzoek naar genetische zelftesten
- Dermatologie project, de invloed van exome sequencing en RNAseq op de profilering van huidlymphonen,
- Omics in de Polder: ontwikkelen van omics-technieken en toepassen voor het monitoren van biodiversiteitsveranderingen
- Biostimulanten; van bol tot in de bodem uitgezocht hier werkt Lindsey aan de uitbreiding van schimmel en entamtoden analyses
- Fermentobiomics: monitoring van fermentatieprocessen mbv omics-technieken
- Monitoring van luchtmonsters op de aanwezigheid van plantenpathogenen in het kader van IPM (penvoerder: WUR)
- Hidden Biodiversity: Improving urban green infrastructure by incorporating hidden biodiversity networks (penvoerder: Naturalis) Ja, wij dien het sequencen van bacteriën, schimmels en korstmossen (WP3).
- BENIGN; BluE and greeN Infrastructure desiGned to beat the urbaN heat (penvoerder: Radbout Universiteit)
- Advanced Precision Food Safety, detectie van voedselpathogenen mbv whole genome sequencing (WGS)
- Optimalisatie van 16S amplicon sequencing mbv operon brede amplicons
- Implementatie van adaptive sequencing.
- Optimalisatie dataflow in combinatie met de geïntroduceerde lab notebooks.
- Opzetten van NextFlow Tower voor high throughput analyses.
- Het metatranscriptoom van kombucha: expressie analyse van DNA en RNA van complexe microbiologische samenlevingen.
Dit zijn de afgeronde onderzoeksprojecten van de Vakgroep Bio-Informatica:
- With help of my little friends
- Rhinoceromics
- eDNA en eMetabolomics
- Een geschikte bodem voor duurzame tulpenteelt
- Een nieuwe biomarker voor de diagnostiek van urineweginfecties in de eerstelijn
- Fusascreen
- Application of bacteria as probiotics in coral reef restoration at Bonaire
- PoreAcademy
- Precision Food Safety