studenten doen onderzoek bij het Leiden Centre for Applied Bioscience

Onderzoeksprojecten Vakgroep Bio-Informatica

Dit zijn de actuele onderzoeksprojecten van de Vakgroep Bio-Informatica: 

  • Check the test; onderzoek naar genetische zelftesten   
  • Dermatologie project, de invloed van exome sequencing en RNAseq op de profilering van huidlymphonen, 
  • Omics in de Polder: ontwikkelen van omics-technieken en toepassen voor het monitoren van biodiversiteitsveranderingen  
  • Biostimulanten; van bol tot in de bodem uitgezocht hier werkt Lindsey aan de uitbreiding van schimmel en entamtoden analyses  
  • Fermentobiomics: monitoring van fermentatieprocessen mbv omics-technieken 
  • Monitoring van luchtmonsters op de aanwezigheid van plantenpathogenen in het kader van IPM (penvoerder: WUR)  
  • Hidden Biodiversity: Improving urban green infrastructure by incorporating hidden biodiversity networks (penvoerder: Naturalis) Ja, wij dien het sequencen van bacteriën, schimmels en korstmossen (WP3).  
  • BENIGN; BluE and greeN Infrastructure desiGned to beat the urbaN heat (penvoerder: Radbout Universiteit)  
  • Advanced Precision Food Safety, detectie van voedselpathogenen mbv whole genome sequencing (WGS) 
  • Optimalisatie van 16S amplicon sequencing mbv operon brede amplicons        
  • Implementatie van adaptive sequencing. 
  • Optimalisatie dataflow in combinatie met de geïntroduceerde lab notebooks. 
  • Opzetten van NextFlow Tower voor high throughput analyses. 
  • Het metatranscriptoom van kombucha: expressie analyse van DNA en RNA van complexe microbiologische samenlevingen. 

Dit zijn de afgeronde onderzoeksprojecten van de Vakgroep Bio-Informatica: