Lectoraat Innovatieve Moleculaire Diagnostiek
Microbiologische Rapid Typing Service
Microbiologische Rapid Typing Service
Typeren van van micro-organismen kan een tijdrovende bezigheid zijn, met lange, en ingewikkelde protocollen. Het Toplab in Leiden biedt een nieuwe service om snel en betrouwbaar micro-organismen te typeren m.b.v. het innovatieve SpectraCell RA® systeem (River Diagnostics BV, Rotterdam), die gebaseerd is op Ramanspectroscopie.
De meest efficiënte wijze om uitbraken in omvang te limiteren, is een snelle karakterisering van de betrokken isolaten, zodat adequate infectie-preventieve maatregelen kunnen worden genomen.
Denk bijvoorbeeld aan het wereldwijde succes verhaal van het Nederlandse Search & Destroy beleid rond MRSA. Toplab Leiden maakt gebruik van het revolutionaireSpectraCell RA®systeem voor snelle en betrouwbare classificatie van micro-organismen (bacteriën, schimmels en gisten) op stamniveau. Na reincultuur genereert deze snelle analysetechniek binnen enkele minuten een resultaat. Het Toplab levert binnen 2-3 dagen na ontvangst een resultaat.
De resultaten
De resultaten worden in de vorm van een clusteranalyse (bij meer dan 10 samples) met een correlatietabel hierin opgenomen, waarbij de interpretatie van deze resultaten en de onderbouwing ervan in een rapport naar de aanvrager wordt gestuurd.
Voorbeeld van een resultaat. In bovenstaande figuur is van links naar rechts weergegeven: de clusteranalyse weergegeven in een dendrogram; gegevens van de isolaat met hierbij aangegeven het cluster waartoe een stam behoort; en de onderlinge correlatie van de Ramanspectra. In dit voorbeeld is de fenotypische relatie van een 12-tal bacteriestammen weergegeven. De interpretatie van deze fenotypische relatie wordt vastgelegd a.h.v. een cut-off waarde (0.9997). De stammen kunnen identiek, verwant of uniek zijn.
Interessante links Raman
Insturen van bacteriestammen voor Ramananalyse
Via het web-aanvraagformulier kunt u de bacteriesstammen aanmelden. Samen met de geprinte versie van dit formulier moeten de bacteriestammen vervolgens geënt als reincultuur in een afgesloten verzendbuis, in een biohazard envelop worden aangeboden.
Het verzendadres:
Toplab Leiden
J.H van Oortweg 21
2333 CH Leiden
Meer informatie en contact
Toplab Hogeschool Leiden
Dr. W.B. van Leeuwen, lector Innovatieve Moleculaire Diagnostiek
Bio Partner Accelerator gebouw
J.H. Oortweg 21
2333 CH Leiden
E-mail: leeuwen.van.w@hsleiden.nl
Tel: 071 5188380 of mail Hinke Dekter (labcoördinator): dekter.h@hsleiden.nl
